一、科学的气流组织
单向流气流组织：针对有着高洁净度要求的负压洁净室，通常会运用单向流气流组织，特别是垂直单向流，这种形式能够最为有效地阻止污染物的扩散。气流从顶部的送风口输入，经过工作区域后从底部的排风口排出，构建起稳定的气流层流，降低涡流以及污染物的滞留情况。
非单向流气流组织：对于洁净度要求相对稍低的负压洁净室，可以采用非单向流（也称为乱流）气流组织。通过合理地安排送风口和回风口，让室内气流形成涡流，但仍然需要保证气流能够顺利地带走污染物，规避死角和二次污染的出现。
二、高效的空气过滤体系
三级过滤手段：负压洁净室应当设置粗效、中效以及高效三级过滤器，对进入室内的空气进行逐层拦截，保证送入室内的空气洁净度能够符合要求。
粗效过滤器：主要用于清除大颗粒的物质和尘埃。
中效过滤器：进一步去除中等粒径的颗粒物。
高效过滤器（HEPA）：能够去除 0.3 微米以上的微粒，过滤效率高达 99.97%以上，是保障室内空气质量的关键所在。
定期的清洗和过滤器更换：为了确保过滤效果，需要定期对粗效和中效过滤器进行清洗，并且在阻力达到设定值的时候及时更换高效过滤器。
三、严密的密封手段
门窗密封：负压洁净室的门窗需要拥有出色的密封性能，防止室外空气或者相邻区域的空气通过缝隙渗透进来。
管道密封：送风管道、排风管道以及回风管道的连接部位需要运用密封材料进行处理，保证气流不会泄漏。
四、负压的控制
维持负压状态：负压洁净室需要保持室内的气压低于室外或者相邻区域，以避免污染物流出。通过对送风量和排风量的调节，让室内气压维持在设定的负压范围之内。
监测和调整：需要定期对室内气压和气流速度进行监测，确保负压状态的稳定。同时，依照实际的需求对送风量和排风量进行调整，以适应不同的工作需要。
五、其他的辅助举措
定期的清洁和消毒：负压洁净室需要定期开展清洁和消毒工作，以清除室内累积的尘埃和微生物。
人员管理：进入负压洁净室的人员需要经过必要的净化处理（例如换鞋、更衣、洗手等等），以减少带入室内的污染物。
物料管理：进入负压洁净室的物料也需要进行净化处理或者采用专用的传递窗进行传递，以降低发尘量。
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